Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX4Q9BYU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX4Q9BYU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms