Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms