Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL25A1Q9BXS0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms