Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIGD2AQ9BW72 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms