Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC2P3Q9BVR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC2P3Q9BVR0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms