Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM109Q9BVC6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM109Q9BVC6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms