Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP25Q9BV90 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP25Q9BV90 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms