Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NDUFAF3Q9BU61 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms