Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THUMPD2Q9BTF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
THUMPD2Q9BTF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
THUMPD2Q9BTF0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms