Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDFIP1Q9BT67 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDFIP1Q9BT67 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms