Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDF4Q9BRK5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms