Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTP3Q9BQQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms