Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOPXQ9BPY8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOPXQ9BPY8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms