Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED2Q99967 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED2Q99967 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms