Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYD88Q99836 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYD88Q99836 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms