Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POP1Q99575 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP1Q99575 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP1Q99575 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POP1Q99575 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POP1Q99575 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POP1Q99575 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POP1Q99575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms