Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAT1Q99536 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms