Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms