Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RMDN3Q96TC7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RMDN3Q96TC7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms