Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARXQ96QS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARXQ96QS3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms