Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALS2CR12Q96Q35 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALS2CR12Q96Q35 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms