Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNT1Q96Q11 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRNT1Q96Q11 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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