Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSPG4P5Q96PW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPG4P5Q96PW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms