Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF558Q96NG5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms