Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIGD1Q96MW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TIGD1Q96MW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TIGD1Q96MW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms