Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC17Q96LX7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC17Q96LX7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms