Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD3Q96L08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD3Q96L08 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms