Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCC12Q96J65 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC12Q96J65 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC12Q96J65 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms