Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGAP3Q96FM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGAP3Q96FM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms