Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNRIP1Q96F85 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNRIP1Q96F85 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNRIP1Q96F85 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CNRIP1Q96F85 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNRIP1Q96F85 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNRIP1Q96F85 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms