Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ECHDC3Q96DC8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECHDC3Q96DC8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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