Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC11Q96DB2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms