Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSUN4Q96CB9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSUN4Q96CB9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms