Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A3Q93084 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A3Q93084 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms