Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD50Q92878 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD50Q92878 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms