Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGGTAQ92696 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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RABGGTAQ92696 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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