Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCG3Q8WXD2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCG3Q8WXD2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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