Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUFY2Q8WXA3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms