Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFT2D1Q8WV19 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms