Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2AF1L4Q8WU68 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2AF1L4Q8WU68 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms