Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDI1Q8WTU0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DDI1Q8WTU0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DDI1Q8WTU0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms