Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM1Q8TC05 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms