Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL2Q8NHH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms