Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYRIPQ8NFW9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYRIPQ8NFW9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms