Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87AQ8NBN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87AQ8NBN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms