Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CLDN19Q8N6F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLDN19Q8N6F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN19Q8N6F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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