Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSL3Q8N5Y2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSL3Q8N5Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3Q8N5Y2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3Q8N5Y2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3Q8N5Y2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSL3Q8N5Y2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms