Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STAG2Q8N3U4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG2Q8N3U4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms