Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT222Q8N1A0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT222Q8N1A0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms