Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP3Q8IZU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP3Q8IZU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms